Şişlərin genetik tərkibi haqqında məlumat, uzunmüddətli perspektivdə klinisyenlərə xərçəng xəstələri üçün ən təsirli müalicə kursu barədə qərar verməyə kömək etməlidir. Ən faydalı olmaq üçün bu molekulyar məlumatlar morfoloji və klinik məlumatları ehtiva edən şiş təsnifatına daxil edilməlidir. Jules Berman bu həftə BMC Xərçəngində yeni hərtərəfli şiş təsnifatı üçün fikirlərini təsvir edir.
Berman, Milli Xərçəng İnstitutunun Xərçəng Diaqnozu Proqramı çərçivəsində Patoloji İnformatika Proqramının Direktoru, ABŞ, yazır: "Bu təsnifat sadədir (şişlərin molekulyar analizindən alınan məlumatların mürəkkəbliyini azaldır), hərtərəflidir (təmin insanın hər bir şişi üçün yer) və şişləri sitogenetik və molekulyar xüsusiyyətlərə görə xarakterizə etmək üçün son cəhdlərə uyğundur."
"Ənənəvi olaraq, şişlər morfoloji görünüşlərinə görə təsnif edilir" deyə davam edir. "Təəssüf ki, oxşar histoloji xüsusiyyətləri olan şişlər tez-tez müxtəlif klinik kursları izləyir və ya kimyaterapiyaya fərqli cavab verir." Alternativ, yalnız şişlərin molekulyar xüsusiyyətlərinə əsaslanan təsnifat, xərçəngli xəstələrin diaqnozu və müalicəsi ilə bağlı praktiki olaraq hər bir klinik qərarı məlumatlandıran klinik/patoloji təcrübələri qurban verəcəkdir.
Həm şişin törədiyi hüceyrələrin növü, həm də həmin hüceyrələrin molekulyar xüsusiyyətləri şişin necə davranacağını müəyyən edir – klinisyenler üçün böyük əhəmiyyət kəsb edən məlumat. Berman bu iki xüsusiyyətdən istifadə edərək təsnifatını təşkil etdi.
Təsnifatın ən yüksək səviyyəsində şişlər komponent hüceyrələrinin inkişaf tarixinə - onların "histogenezinə" görə qruplaşdırılır. Məsələn, leykemiya mezenximadan qaynaqlanan şiş kimi təsnif edilə bilər. Gen ifadəsindən və şiş nümunələrinin proteomik məlumatından müəyyən edilən nümunələr daha sonra bu təsnifat çərçivəsində yeni qruplar kimi inteqrasiya oluna bilər.
Berman yazır: "Bu qruplaşmalardan bəzilərinin spesifik bioloji xüsusiyyəti var, məsələn, metastaza meylinin artması, kimyaterapevtik agentə daha yüksək reaksiya və ya sağ qalma müddətinin uzadılması."
Hər bir şiş fərdi nəsil olan hüceyrədən törədildiyi üçün təsnifat daxilində unikal mövqeyə malik olacaq. Tez-tez istifadə edilən şiş təsnifatları şişləri bədənin mənşəyinə görə siyahıya alır. Bununla belə, hər bir orqan birləşdirici toxuma, damarlar və limfoid toxumadan ibarətdir. Bir orqanda meydana gələ biləcək şişləri sadalamağa başlayanda görürsən ki, hər bir orqan eyni şişlərin çoxunu inkişaf etdirə bilər. Anatomik sahə tərəfindən təşkil edilən təsnifatlar kütləvi şəkildə lazımsız hala gəlir və bu, digər bioloji məlumat dəstləri ilə əlaqə saxlayan minlərlə şiş termini ilə işləyərkən böyük problemə çevrilir.
"Yaxşı təsnifat sistemi nəhəng verilənlər bazalarının mürəkkəbliyini az altmağa kömək etməli və məlumatları həssas qrup iyerarxiyaları altında toplamaqla müxtəlif məlumat elementləri arasında əlaqələri aşkar etməyə kömək etməlidir" deyə Berman yazır. "Bu (yeni) təsnifatın ən mühüm dəyəri şiş növü və şişin mənşə yerinin ayrılmasıdır… Bu, oxşar molekulyar profillərə malik olan şişləri anatomik yerdən çox, bioloji xüsusiyyətlərə görə təsnif etməyə imkan verir."
Təsnifat konturları (XML-də) və təsnifatın ən son versiyası (55.000 girişlə) biotibbi icma tərəfindən sərbəst şəkildə istifadə edilə və ya tənqid oluna bilən əlavə Açıq Giriş sənədləri kimi məqalə ilə birlikdə mövcuddur.
Bu press-reliz aşağıdakı məqaləyə əsaslanır:
Şiş təsnifatı: molekulyar analiz Aristotel Jules J Bermana cavab verir.
Bu məqalə dərc edildikdən sonra BMC Xərçənginin Açıq Giriş siyasətinə uyğun olaraq http://www.biomedcentral.com/bmccancer vasitəsilə pulsuz əldə ediləcək.
BMC Cancer (http://www.biomedcentral.com/bmccancer) həmyaşıdlarına Açıq Giriş təmin etmək öhdəliyi götürmüş müstəqil onlayn nəşriyyat olan BioMed Central (http://www.biomedcentral.com) tərəfindən nəşr edilmişdir. bioloji və tibbi tədqiqatları nəzərdən keçirdi. Bu öhdəlik elmin sürətli və səmərəli kommunikasiyası üçün tədqiqata dərhal sərbəst çıxışın və dərc edilmiş məlumatların sərbəst arxivləşdirilməsi və təkrar istifadəsi imkanının vacib olduğu fikrinə əsaslanır. BioMed Central hazırda biologiya və tibb üzrə 100-dən çox jurnal nəşr edir. Açıq girişli orijinal tədqiqatdan əlavə, BioMed Central həmçinin rəylər, şərhlər və digər orijinal olmayan tədqiqat məzmununu dərc edir. Fərdi jurnalın siyasətindən asılı olaraq, bu məzmun açıq giriş ola bilər və ya yalnız abunəçilərə təqdim edilə bilər.
