STANFORD, Kaliforniya - San-Fransisko, Peter Small, MD olan açıq hava laboratoriyasından istifadə edərək, demək olar ki, son 13 ildə şəhərdə baş vermiş hər bir vərəm hadisəsindən nümunələr topladı - demək olar ki, cəmi 3000. The Proceedings of the National Academy of Sciences jurnalının bu həftəki qabaqcadan onlayn buraxılışında Stenford Universiteti Tibb Məktəbinin yoluxucu xəstəliklər və coğrafi tibb üzrə dosenti və həmkarları bu nümunələrdən 100-nün genetik analizini təqdim edirlər. Tapıntılar bakteriyaların ev sahibinin immun sistemindən qaça bilməsi və ya antibiotik müqaviməti inkişaf etdirə biləcəyi yolları təklif edir.
Komanda jurnalın eyni sayında dərc olunan ikinci məqalədə təhlilini bir addım irəli apardı. Onlar yoluxucu xəstəliklərin ötürülməsində sosioloji qarşılıqlı əlaqənin vacibliyinə işarə edərək, dünyanın müxtəlif regionlarından olan insanların vərəm bakteriyasının müxtəlif suşlarını daşıdığını aşkar ediblər. Bu, həm də patogenin coğrafi populyasiya qrupu daxilində təkamül etməsi və digər qruplara yayılmaması ehtimalını artırır.
"Genetikanın qlobal coğrafiyaya nə qədər yaxşı uyğunlaşması diqqətəlayiq idi" dedi Small. "Birgə təkamül olduqca spekulyativdir, lakin bu, maraqlı bir ehtimaldır. Ən əsası, bu, indi həll etmək üçün texnologiyamız olan bir fərziyyədir."
Vərəm hər hansı digər yoluxucu xəstəliklərdən daha çox böyüklər arasında ölümə səbəb olur. Dünyada hər üç nəfərdən biri yoluxur, lakin bu, ilk növbədə inkişaf etməkdə olan ölkələrdə problem olaraq qalır. Bununla belə, sənayeləşmiş ölkələrdə çoxsaylı dərmanlara davamlı vərəm suşlarının yaranması peyvəndlərə marağın yenidən artmasına səbəb olur.
Vərəm bakteriyasının bütün dünyada fərqli olduğuna dair çoxdan lətifə sübutları var, dedi Hal-hazırda Stanforddan məzuniyyətdə olan və Bill və Melinda Qeyts Fondunun Qlobal Sağlamlıq Proqramında baş proqram zabiti kimi xidmət edən Small. Əlavə olaraq, onun sözlərinə görə, vərəm əleyhinə vaksinləri sınaqdan keçirən tədqiqatlar, dünyanın müxtəlif bölgələrində aparılan zaman onların nə qədər yaxşı işlədiyinə görə geniş şəkildə fərqlənir, bu da hər bir sahənin öz peyvəndi tələb oluna biləcəyini göstərir.
Genetik analiz vasitəsilə Small qrupu San-Fransiskoda birinin başqa bir şəxsdən yoluxduğu vərəm halları ilə daha əvvəl yoluxma nəticəsində yaranan hallar arasında ayrı-seçkilik edə bildi. Aaron Hirsh, doktoranturadan sonrakı alim və ikinci məqalənin aparıcı müəllifi PhD, tədqiqatçıların bir icma vasitəsilə ötürülməsini izləyə biləcəyi bakteriyaların genetik "barmaq izlərinə" malikdir.
Small's laboratoriyası mikroarraylar - vərəmin bütün ardıcıllığını əhatə edən DNT parçaları olan şüşə slaydlar - istifadə edərək San-Fransiskodakı xəstələrdən təcrid olunmuş xəstəliyin 100 fərqli suşunun genomlarını araşdırdı, spesifik, geri dönməz genetik dəyişiklikləri hərtərəfli müəyyən etdi. barmaq izi kimi.
Bu tədqiqatlar zamanı Hirsh biologiya elmləri bölməsində Marcus Feldman, PhD, The Burnet C. və Mildred Finley Wohlford professorunun laboratoriyasında aspirant idi. Hirsh molekulyar təkamül təcrübəsini vərəmin genetik məlumatını ştamlar arasında ümumi cəhətləri göstərmək üçün ailə ağacına bənzər sadə bir qrafikdə birləşdirmək üçün tətbiq etdi.
Ağac təmsil olunan 100 suşla çəkildikdən sonra tədqiqatçılar yoluxmuş şəxsin milli mənşəyinə əsasən hər bir ştama öz rəngini təyin etdilər. "Ağacın bir budaqda çəhrayı, digər budaqda mavi və digər budaqda qara olması təəccüblü idi" dedi Hirsh."Bu insanların yarısı şəhərə gəldikdən sonra vərəm xəstəliyinə tutulsa da, insanın doğulduğu yerdən asılı olaraq o qədər səliqəli şəkildə çıxdı."
San-Fransiskonun şəhər şəraitində yaşayan müxtəlif milli mənşəli insanlar arasında bakteriya mübadiləsinin olmaması Hirşi təəccübləndirdi. "Mən şübhələnirəm ki, ən ağlabatan izahat sosiologiya ilə bağlıdır. Asiyadan olan immiqrantlar əslində dünyanın digər yerlərindən gələn immiqrantlarla və ya yerli amerikalılarla qarışmırlar" dedi Small. "Ancaq çaşdırıcı tərəf odur ki, Asiya vərəmi Qızıl Tələsmə zamanı ortaya çıxmalı idi və siz düşünürsünüz ki, aradakı 150 il ərzində bu ştammların yayılması üçün geniş imkanlar olacaq. Biz sadəcə olaraq görmədik. ki."
Onların təhlilinin praqmatik nəticəsi, Kiçikin dediyinə görə, insanların immun sistemlərinin HİV-də nümayiş etdirilənlər kimi vərəmə necə reaksiya verməsi ilə bağlı gərginlikdən gərginliyə fərqlərin olub-olmadığını həll etmək bacarığıdır."Bunun peyvəndin inkişafı üçün dərin təsirləri var" dedi. "Nəhayət, dünyanın müxtəlif hissələri üçün fərqli peyvəndlər hazırlamalı ola bilərik. Bu, tamamilə açıq sualdır, lakin biz indi cavab verməyə başlaya bilərik."
Entoni Tsolak, PhD, genetik analiz məqaləsinin ilk müəllifi, Peter Smallun laboratoriyasında doktorluqdan sonrakı alim idi və o vaxtdan İngiltərəyə qayıtdı. Milli Sağlamlıq İnstitutunun qrantları hesabına maliyyələşdirilən bu tədqiqatlara əlavə yeddi Stenford tədqiqatçısı cəlb edilib.
