Protein Ardıcıllıqları: Axı o qədər də proqnozlaşdırıla bilən deyil

Protein Ardıcıllıqları: Axı o qədər də proqnozlaşdırıla bilən deyil
Protein Ardıcıllıqları: Axı o qədər də proqnozlaşdırıla bilən deyil
Anonim

4 Mart 2004 - Elm adamları onilliklər boyu inanırdılar ki, insan genomunun ardıcıllığı avtomatik olaraq zülalların ardıcıllığını, genlərin funksional məhsullarını verəcək və beləliklə, insan hüceyrə biologiyasının arxasında duran mexanizmlərin açılmasına gətirib çıxaracaq. xəstəlik. Bununla belə, Lüdviq Xərçəng Tədqiqatları İnstitutu (LICR) tərəfindən bu gün Elmdə nəşr olunan bir məqalədə zülalın geninin DNT ardıcıllığından çıxarılmasının qəbul edilmiş paradiqmasına şübhə yaradan yeni hüceyrə prosesi təsvir olunur.

Bir zülal hüceyrə prosesində fəaliyyət göstərməyə çağırıldıqda, genin DNT-nin seqmentləri (eksonları) RNT fraqmentlərinə köçürülür, daha sonra DNT tərəfindən kodlaşdırılan istiqamətlərə uyğun olaraq bir-birinə birləşdirilir (birləşir). RNT transkripti daha sonra zülal meydana gətirən amin turşularına çevrilir. Hüceyrə artıq zülal tələb etmirsə, o, “proteazom” adlı xüsusi kompleks tərəfindən parçalanır. Funksional olaraq fərqli zülallar bir gen ardıcıllığından istehsal oluna bilsə də - amin turşularına kiçik molekulların əlavə edilməsi yolu ilə modifikasiya, ardıcıllığın kəsilməsi və ya bəzi ekzonları buraxan RNT transkriptlərinin tərcüməsi ilə - bunlar müəyyən edilmiş mövzu üzrə variasiyalardır. əsasən genin DNT ardıcıllığı ilə. Bununla belə, Belçikanın Brüssel şəhərindəki LICR filialının alimləri indi sübut etdilər ki, insan zülalının ardıcıllığı əslində proteazom tərəfindən gen ardıcıllığı tərəfindən tamamilə gözlənilməz şəkildə dəyişdirilə bilər. Kəşf həm zülalın emalı üçün yeni bir prosesdir, həm də proteazomun indiyədək heç bir şübhəsi olmayan yeni roludur.

“Tərcümə sonrası birləşmə” LICR komandası xərçəng hüceyrələrinin mövcudluğuna cavab olaraq immunitet sistemini aktivləşdirən kiçik zülal ardıcıllıqlarını təhlil edərkən kəşf edildi. Bu “peptid antigenləri” proteazom xərçəngə xas zülalı peptidlərə parçaladıqda yaranır, daha sonra immunoloji məhv olmaq üçün hüceyrəni qeyd etmək üçün hüceyrə səthinə daşınır. Komanda melanoma hüceyrələrini tanımaq və məhv etmək üçün immunitet sistemini stimullaşdıran bir peptid antigeninin gen ardıcıllığı ilə proqnozlaşdırılandan tamamilə fərqli bir ardıcıllığa sahib olduğunu aşkar etdi. Daha çox araşdırma apardıqdan sonra tədqiqatçılar proteazomun bir peptidi üçə böldüyünü və daha sonra parçaları yenidən birləşdirdiyini, beləliklə, indi immun sistemi tərəfindən tanınan peptid antigeninin orijinal ardıcıllığının bir hissəsini itirdiyini aşkar etdilər.

“Tərcümə sonrası birləşmə özlüyündə heyrətamiz bir prosesdir,” tədqiqatın baş müəllifi Dr. Benoit Van den Eynde deyir, “lakin bunun xərçəng və ya HİV vaksinlərinin dizaynı üçün də mühüm təsirləri var. peptid antigenlərinə əsaslanır. Peyvəndlərin erkən fazalı klinik sınaqlarında tədqiq edilən sintetik peptidlər adətən xərçəngə xas zülalların gen ardıcıllığına əsaslanaraq tərtib edilir. Bununla belə, post-translational splaycing peptid antigenlərini indiyə qədər heç şübhə etmədiyimiz şəkildə dəyişdirə bilər."

Tərcümə sonrası birləşmiş, yeni peptid antigenləri ilə proqnozlaşdırılan məsələ xəstələrdə xərçəng peyvəndlərinə immunoloji reaksiyaların monitorinqi zamanı xüsusilə vacib məsələdir. Mövcud metodologiyalar adətən proqnozlaşdırılan peptid antigeni üçün spesifik T hüceyrələrinin mövcudluğunu ölçür və yeni peptid antigeni üçün spesifik T hüceyrələrini aşkar etmir. Xərçəng və/yaxud viral yolla yoluxmuş hüceyrələrlə bağlı proteomun vasitəçiliyi ilə post-translational splicing baş verib-vermədiyini və əgər belədirsə, bu xəstəliklərdə belə yeni peptid antigenlərinin baş vermə tezliyini müəyyən etmək üçün əlavə tədqiqatlar tələb olunur.

Tərcümə sonrası birləşmənin kəşfi immunoloqları antigenin identifikasiyasındakı əlavə fəsadlarla maraqlandırdı və hüceyrə bioloqlarını proteazomun hiylələr çantasına dair yeni bir fikir həyəcanlandırdı. Bununla belə, genetiklər və biokimyaçılar üçün post-tərcümə birləşməsinin kəşfi bir qədər narahatlıq hissi yarada bilər. Translational splicing-in nə vaxt, niyə və nə qədər tez-tez baş verdiyini dəqiq bilənə qədər, insan genomunun zülal ardıcıllığını proqnozlaşdırmaq üçün bütün cavabları özündə saxladığını avtomatik olaraq güman edə bilmərik

Bu tədqiqat Belçikanın Louvain Universitetinin Lüdviq Xərçəng Araşdırmaları İnstitutunun Brüssel filialının və Liege Universitetinin Eksperimental Cərrahiyyə Laboratoriyasının tədqiqatçılarından ibarət qrup tərəfindən nəşr edilib.

Lüdviq Xərçəng Araşdırmaları İnstitutu

Lüdviq Xərçəng Araşdırmaları İnstitutu (LICR) xərçəngi anlamaq və ona nəzarət etmək üçün fəaliyyət göstərən ən böyük beynəlxalq akademik institutdur. Yeddi ölkədə on Filial və bir çox başqa ölkələrdə çoxsaylı Filiallar və Klinik Sınaq Mərkəzləri ilə LICR olan elmi şəbəkə sözün həqiqi mənasında bütün dünyanı əhatə edir. LICR-nin unikallığı təkcə ölçüsündə və miqyasında deyil, həm də fəlsəfəsində və nəticələrini laboratoriyadan klinikaya çatdırmaq bacarığındadır. LICR təsir edici reagentlər, biliklər, təcrübələr və əqli mülkiyyət portfelini işləyib hazırlayıb, həmçinin öz laboratoriya tədqiqatlarının ən perspektivli aspektlərini patentləşdirmək, kliniki qiymətləndirmək, lisenziyalaşdırmaq və beləliklə də tərcümə etmək üçün lazım olan personalı, imkanları və təcrübələri toplayıb. xərçəng müalicələrinə.

Məşhur mövzu