HİV-1 (QİÇS-ə səbəb olan virus) yaratmaq üçün molekulyar mexanizmdə rol oynaya biləcək incə struktur dəyişikliyi Milli Standartlar və Texnologiya İnstitutunun (NIST) və Merilend Universitetinin alimləri tərəfindən müəyyən edilib. Biotexnologiyada Qabaqcıl Tədqiqatlar Mərkəzində (CARB) işləyir. Canlı hüceyrələrdə təsdiq olunarsa, Proceedings of the National Academy of Sciences jurnalının 20 yanvar onlayn buraxılışında təsvir edilən mexanizm virus əleyhinə dərmanlar üçün yeni hədəf təmin edə bilər.
Bu tapıntı CARB-nin ribonuklein turşusunun (RNT) qarşılıqlı təsirlərini sürətlə aşkar etmək və kəmiyyətini təyin etmək üçün həssas alətlər hazırlamaq və təsdiqləmək səylərindən son zamanlarda ortaya çıxan bir neçə tapıntı arasındadır. RNT HİV-1 kimi retrovirusların genetik planını təmin edir. CARB alimləri HİV-1 viral hissəciklərinin əmələ gəlməsində iştirak edən RNT struktur elementindəki dəyişiklikləri izləmək üçün model sistem yaratdılar.
Yeni HİV-1 virusları əmələ gəlib yoluxucu hissəciklərə çevrildikcə, iki RNT zəncirinin "molekulyar öpüş" adlanan keçici struktur vasitəsilə qarşılıqlı əlaqəsi var. Bu struktur daha sonra yoluxmuş hüceyrədən çıxdıqdan sonra daha da yetkinləşən yeni virus hissəciklərinə qablaşdırılır. CARB alimləri müəyyən ediblər ki, "öpüşmə" strukturunda xüsusi yerlər canlı hüceyrələrə yaxın pH-da proton (müsbət yüklü hissəcik) əldə edir. Protonun mövcudluğu RNT strukturunu dəyişdirir və virusun yetişməsi ilə əlaqəli bir zülal tərəfindən yenidən qatlanmasını sürətləndirir. Birlikdə götürdükdə, bu müşahidələr belə bir mexanizmin virus infeksiyası zamanı işlək ola biləcəyini göstərir.
RNT-nin bağlanmasını və qatlanmasını real vaxt rejimində izləmək üçün CARB alimləri RNT hissələrini əvəz edən flüoresan markerlər hazırladılar. Flüoresan siqnalındakı dəyişiklikləri izləməklə alimlər bu reaksiyaları izləyə bildilər. Alimlər həmçinin RNT-də proton əldə edən yerləri müəyyən etmək və nəticədə yaranan konformasiya dəyişikliklərini xarakterizə etmək üçün nüvə maqnit rezonansından istifadə ediblər.
